服务区休息太久是会超时的，因为高速公路超时的规定是，当车辆在高速公路停留时间超过24小时，或者在相同的路段上停留时间超过12小时，这种情况下就需要支付相应的高速超时费。正常情况下高速公路上超时，都是由于在服务区内休息时间过长引起的，因为在服务区内休息时间，也会累积在高速公路行驶时间内。
目前各个省份对于在高速公路服务区内休息超时的处理方式会有一些区别，有些省份并不会给予处罚，但有些省份需要车主提供在服务区内休息的证明，只要有充足的证明，就可以把在服务区内休息的时间，从高速公路行驶时间内去除，具体证明可以用行车记录仪或者服务区消费小票等。
之所以有高速超速的规定，最主要就是为了打击一些驾驶人在高速期间存在逃费的情况。比如两辆相反方向的车子，提前沟通好在驾驶期间或者在服务区内，把通行卡更换，或者更换假卡等，从而避免支付高速费用。
